崇祯十二年（1639）二月，清亲王多尔衮率军饱掠后，从山东北返至天津卫，渡运河东归。三月初九，清军从青山口出关，退回辽东。是役，清军入关达半年，深入二千里，攻占一府、三州、五十五县，二关；杀明总督二、守备以上将吏百余人；俘获人口二十六万余、黄金两千余两、白银四十七万余两。中原人民所遭受的苦难和财产损失无可计量。
如果孙大爷不回北京，损失将更大。
历史上，清军俘获人口四十六万余、黄金四千余两、白银九十七万余两。
京畿残破。清军退去后，朝廷没有马上组织重建，而是搞起了批斗会。各方角色纷纷登场，互相攻击，互相批斗，搞得不亦乐乎。
其中以孙承宗被批斗的最厉害。
反倒是屡次犯错的杨嗣昌，因为被免职在家，没有成为主攻目标。
顶不住压力的孙大爷提出辞职，这招以退为进，自古以来都是保命良方。朱由检亲自召见孙大爷，表达了善意的安慰。
大意是说：“孙老师，你继续背黑锅，不要退缩，一定要坚持住。放心，有我在后面挺你。”
孙大爷表示感动，在一片骂声中，开始为挽救大明王朝努力。
孙大爷最先恢复了边境的防御，并加固了墙子岭、青山口防线。然后遣散来自各地的援军，各归所部，特别是四川、湖广、浙江的援军。现在大明王朝有三个敌人，辽东的鞑子、陕西的农民军、福建的哈大全。
如果只有一个敌人，大明都摆平。可是一次冒出来二个敌人，大明朝就死定了。
为此孙大爷提出一个建设性意见。“拉住哈大全，防住满清，剿灭农民军。”
朱由检听后深有感悟，马上就同意了孙大爷的建议。并封了孙大爷有史以来最大的官：十省督师。
把大明半壁江山交给了孙大爷。
除了朱由检，就数孙大爷的官最大。
孙大爷上台后召集了三个人，其中有二个猛人，一个名嘴。
这两个猛人是洪承畴和祖大寿。祖大寿主管辽东，洪承畴主管陕西。
至于名嘴熊文灿，是专门用来稳住哈大全的。熊文灿真的很能讲，曾经说动哈大全的部将纪大海，迫使哈大全痛下杀手。
虽然熊文灿被哈大全关着，孙大爷相信，只有朝廷的任命到马尾，哈大全一定会放人。
果然，任命熊文灿为浙江巡抚的任命一到，哈大全就把熊文灿放了。同时走的还有钱谦益，他被掉回北京，给孙大爷打下手。
熊文灿带着家眷，学生逃到浙江。命暂时保住了，这时他收到一封孙大爷的信。上面写了两个字：“求贼。”
熊文灿仰天叹息道：“我熊文灿一生的清名，就这样毁了。”
熊文灿在浙江就呆了半个月，又屁颠屁颠的跑回马尾。他脸上少了大义凛然，多了几分的谦卑，多了十二分的献媚。
转变之快，让江南学子大骂熊文灿是：“闽孙。”就是哈大全的孙子。
熊文灿听到此话，惨笑说：“各人荣辱与国家大义相比微不足道。希望我今天所做的，百年之后会被世人理解。”
熊文灿要见哈大全费劲，见马尾其他的官员还是可以的。他回到马尾之后，唯一的工作就是请客吃饭。没有周末，没有节假日，天天请。上午吃完下午吃，下午吃完晚上吃。一天要请好几批马尾的官员吃饭。