按照大明的制度，哪怕是总督这样的地方大员，属下有品级的官员也没有多少，如何处理庞大而繁杂的事务，只靠总督一人肯定不行，所以每一个总督都会自行招募许多的幕僚，协助自己处理各项事宜。
各个督抚手下，都有许多这样的幕僚，多是功名无望的读书人。陈越在南京时，原本也有许多士子想到他的麾下任幕僚，可惜陈越后来在媚香楼的举动，得罪了整个复社，方名夏甚至做了一出类似桃花扇的戏曲，来讽刺陈越，这使得陈越在南京士林名气极差，竟然没人肯为他效力。当然，陈越也不准备用这些除了嘴炮屁都不会的读书人，他要的是真正有能力的人，而不是读了几本诗书只会舞文弄墨之人。
余枫林给陈越勾画的幕府则是一个很是复杂的机构，竟然和官府机构极为类似，要比招募几个幕僚帮着处理事务负责无数倍。
按照余枫林的规划，整个幕府分为战训、参谋、敌情、镇抚、军械、后勤六个司，分别管理下辖军队所有事情。竟然比照府县六曹设置幕府体系。而陈越又按照自己的理解，参照后世军队的机构，给各司设计增加了独有的职能。
战训司负责士兵的招募，以及所以新募士兵的训练，训练周期为三个月，完成训练的新兵再编入各军。有了战训司，就把陈越辖下所有军队的募兵权收了上来，所有将领无权自行招募军队，士兵的缺额只能由都督府统一补充，如此有利于控制下辖军队。
参谋司顾名思义，就是参赞军务，战时负责制定作战计划，平时测量各地地形制作地图，行军时制定行军路线日期等等。战争从来就是复杂的事务，设计到的方面极多，天时地利人和这些只是大而笼统的概念。
而实际上一条河流突然涨水就会导致一支军队延迟一日乃至数日到达指定的战场，从而导致一场战事的失利。一场突入其来的暴雨就会使得骑兵陷入绝境，就会使得弓弦松软，使得火铳无法发射，从而影响战争的胜负。
对于战争天赋极高的名将来说，也许这些都不成问题。可是对于资质普通的将领，有了参谋司的筹谋，至少可以避免很多失误，也就增加了胜利的可能。而战争，往往比的就是交战双方谁犯得错误更少。
陈越自认不是名将，虽然从军一年多，可对战争还是一知半解，也就靠着超前的见识打了一些胜仗。可他打的也多是小规模的战役，遇到的也多是如高杰、刘良佐这样的“名将”，并未和这个时代真正的强军交手。
而按照原本的历史，不到一年，满清主力就会南下攻明。而八旗兵，可以说是这个时代最强的军队了吧，军队里多是征战沙场多年强兵悍卒，都是职业军人，组织力强大，士兵的个人战力更是惊人。