而神舟文明，在这股质疑与不信任的浪潮冲击下，内部矛盾日益激化，几乎到了分崩离析的边缘。
终于，50多个文明共同构筑的神舟文明联合体到达了它承受的极限，再也无法坚持了。
随着一个小型的文明的叛逃，也悄然拉开了神舟文明联合体分裂的序幕。
这次的叛逃，如同多米诺骨牌，引发了连锁反应。那些长久以来潜藏在和谐表象下的矛盾与分歧，此刻如同火山爆发般汹涌而出，再也无法被压抑。
各文明内部出现了无数的矛盾，若是要维系自身文明存续与稳定，对外开战似乎成为了某种无奈而又必然的选择。
各个文明之间相互猜疑日益加剧，信任的基础逐渐崩塌，原本脆弱的信任基石逐渐瓦解，昔日的盟友关系在转瞬之间转变为对手，乃至敌人，黑暗森林也终于笼罩到神舟文明之中。
所有人都清晰地意识到，战争或许无法避免了，那根因“黑暗森林”法则而紧绷的弦终于断裂，战争的爆发比任何人预想的都要来得更早、更猛烈。
不过即便此刻，人类文明、三体文明、山文明、恐龙文明、膜文明、微文明之间的联盟却始终坚如磐石，未曾有丝毫动摇。
对太阳系与三体星系的历史与现状有着深入的了解。特别是人类与三体文明，作为长期以来的竞争对手，他们或许比任何人都更为了解彼此。
他们只有一个简单的信念：若这个宇宙让我们彼此攻击，那我们偏偏不会屈服。即使自己被攻击，那只能证明自己错了。
黑暗森林中不存在信任，但人类与三体在几十万年的对手中做到了。生存与发展是文明的第一要素，但“信任”明显是打破了这一准则。
这场文明混战横跨了数千光年，历经一千多年，其结局却是异常悲惨。
人类、三体、山、恐龙、膜、微等文明的主力就几乎损耗殆尽，仅存的力量不足原先的十分之一。
在这场浩劫中，40多个文明遭受了灭顶之灾，其中十数个文明的火种彻底熄灭，未能留下任何传承。
部分文明虽侥幸逃脱，但所保留的火种也仅剩万分之一；而另一些文明，则在绝望中选择了逃离，以期在宇宙的某个角落寻找新的生存机会。
这场战役的惨烈程度，远远超出了所有人的预料。甚至神舟文明内部也有很多怀疑曾经的决策是否正确，联合文明这条路真的正确吗？
联合的文明在文明技术发展上，的确拥有无法比拟的优势，但真正的联合文明又岂是能如此简单的达成。粗糙的文明联合就如那40多个文明一样，同样会带给神舟覆灭的危机。
随着战争的尘埃落定，幸存下的神舟，意识到，真正的危机才刚刚开始。
潜藏在暗处的菌文化或许就在附近，正悄悄逼近，准备对神舟的残余力量发动最后的绝杀。
终于，菌文明出现了！
原本神舟文明认为自己是可以与菌文明对抗的，尽管自己的力量只是巅峰时期的十分之一，但文明之战与数量并没有直接的关系。
数千年来菌文明没有动手，就说明菌文明是对神舟是有忌惮的。
当真正开战后，神舟才知道自己错的有多离谱，也见到菌文明是如何将规则化为武器。
开战后的一瞬间，神舟就被彻底的绝望说笼罩……