而袁崇焕到了三边总督任上之后的种种举措，不管是废除以前这些洮商世家辛苦积存的盐引也好，还是将三边商户对外的贸易之权，统一收归三边茶马司垄断也好，都是触及了这些世家大族的底线。
更敏感的是，袁崇焕以三边总督府的名义，公然支持那些不知道从哪里就突然冒出来的一批夷教传教士过来，在木速蛮礼拜寺的附近，修建什么天主堂，传播别的福音教义。
这样的做法，更是触犯了这些边将背后的各大木速蛮经堂和礼拜寺大小莫洛、阿訇们的权威。
从宁夏、固原到洮岷之地的木速蛮中，本来就已经怒火遍地地燃烧了，结果袁崇焕又不教而诛，以抗命不遵为由，杀了赵大胤、马万寿。
这下子，无疑等于是火上浇油了。
马进忠、马光玉、丁国栋、米喇印这些洮岷将领，与赵大胤、马万寿本就同气连枝，赵大胤、马万寿获罪被杀，他们心里自然也十分恐惧。
这些人可不管你是不是有什么尚方宝剑，就你不分青红皂白，连个扣押送审，请示朝廷的程序都不走，直接就给杀了，他们作为赵大胤的部将，又岂能不害怕？
因此，等到杨麒率领自己的中军，带着三边总督府的文告和命令，信誓旦旦地赶到洮州坐镇的时候，一说要接管和整编原属洮岷副总兵麾下的六千多军队，马进忠、马光玉等人立刻就炸了营了。
积压了许久的怒火，也立刻就爆发了出来。
洮州城中的木速蛮边军数千人，在马进忠等人的带领下，包围了杨麒进驻接管的洮岷副总兵衙门，要求杨麟将三边总督袁崇焕擅杀边将的事情上报朝廷，一切听候朝廷处置。
但却被杨麟毫不客气地予以拒绝。
从兰州风风火火赶来洮州接管本地军务的杨麒，以为自己身为朝廷九边重镇的经制总兵官，前来接管洮州防务，应该是顺理成章、轻而易举的事情，谁还敢动自己咋地？
但是让他始料不及的是，马进忠、马光玉在杨麟拒绝为赵大胤申辩之后，立即挥兵攻打洮岷总兵府，要捉拿和扣押杨麒进行兵谏。
结果，这样一来，洮州城内的局势很快就彻底失控了。
城内许多木速蛮信众，在本地经堂、礼拜寺大小莫洛阿訇们“万物非主，惟有真主”“打杀红毛、驱逐夷教”等口号的号召和煽动之下，很快就加入了兵变之中。
本来还没有想好到底要闹到何种程度的马进忠等人，也被这些狂热的的口号和情绪所鼓舞，被全城暴动的木速蛮所裹挟，冲进了洮州城内的总兵府里，将立足未稳的总兵官老将杨麒当场杀死。
紧接着，洮州城一片大乱，被城内礼拜寺和经堂中的大小莫洛煽动起来的木速蛮暴民和士卒，不仅杀了杨麒及其随从护卫人员，而且洮州卫城内为数不多的汉官汉军和汉民，也被杀害。
正在洮州城内辛苦修建天主堂的耶稣会传教士龙华民，以及追随龙华民来到洮州传教布道的教士王丰肃、罗雅格、曾德昭三人，还有跟着这些人从京师远赴西北侍奉天主的汉人天主教徒，全部被生擒活捉。
龙华民等四个被木速蛮称为红毛夷人“邪教徒”的西洋传教士，被捆绑在洮州城内的大礼拜寺前空地上，裹上毡毯，涂满油脂，然后活活烧死。
而那数十个跟随前来的汉人天主信徒，也被摁倒在大礼拜寺前的广场上，众信徒面朝西方，在本地掌教阿訇（礼拜寺的伊玛目）赵锡赫的带领下，一番念经祷告，然后将这些被他们称为走上了邪路的“卡非勒”全数斩首处死。
洮州城内发生的变乱，很快就像是一种流行的瘟疫一样，波及到了附近的岷州、临洮、河州、定西等地，并且继续一路向北，向着固原、宁夏等地传播开来。