大明朝廷在南海的一系列举动对于郑芝龙来说无疑是在威胁他们郑家赖以生存的生存利益。
常言道，断人财路如杀人父母，而朱由校现在做的就是断郑芝龙的财路，争夺郑芝龙在海洋上的势力范围。
这让郑芝龙很难再对朝廷抱有任何好感和期望，包括他的那些已经在海洋贸易上占据足够多的利益的部将们，也不再愿意让自己的头子郑芝龙投靠朝廷。
他们本来所期盼的就是名义上归附朝廷，这样获得个一官半职，使得自己的海洋利益更加合法化，自己也可以因此在占据海洋利益后参与内陆利益的划分，并成为真正的一方诸侯。
事实上，原本历史上的郑芝龙就是这么做的，那时的大明朝廷因为没有自己的海上势力再加上内忧外患，只能接受他的招安，而不能有任何其他条件。
而如今的朱由校已经完全压制的满清势力只能局限在辽河以北求生存，关内的农民起义不但没有，流民问题还得到了彻底解决，所以现在的朝廷完全就有能力腾出手来与郑芝龙等海盗讨价还价，想要个光鲜的身份可以，当得拿你自己的利益来换，名器不可滥用，朝廷不会无缘无故的把尊贵的政治身份赐给你。
如此一来，熊文灿的招抚工作最终就宣布以失败而告终，但他没有因此而感到有丝毫的沮丧，而是不由得松了一口气。
夹杂在朱由校和郑芝龙之间拼命斡旋的他实在是受够了这夹板气，他很难做到既要让朝廷满意又要让郑芝龙满意。
如今很好，郑芝龙的人彻底离开福州，而朝廷也下达了停止招抚郑芝龙的令旨，熊文灿觉得自己也可以痛痛快快的花间一壶酒了。
朝廷也没有因此惩罚熊文灿，即便是御史也没有弹劾熊文灿玩忽职守，工作不得力，甚至还让他如愿成为了福建巡抚，并令他加强海防，以备他日之患。
熊文灿很感激朝廷不但未因他招抚工作没有成功而降级罢官反而升了他做巡抚，也因此他在升任巡抚后也不敢再怠慢，为了证明自己确实够做一省督抚，他也开始着手立即布置对他日郑芝龙海盗劫掠沿海的准备。
郑芝龙这边并没有立即选择与朝廷开战，但备战却已经在继续，他开始去接洽以前与他有嫌隙的其他海上势力，开始通过各种方式去购置更多的火炮，他甚至还派眼线去京城和边镇一带，企图通过官场的腐败搞到些现今朝廷最为厉害的火器。
除此之外，郑芝龙也在寻求上政治上的盟友，他甚至还派人去寻觅建文帝的后世子孙，这虽然有些天方夜谭，但据锦衣卫上报，的确在几个建文帝落脚之地传说最为频繁的地方都突然出现过许多闽南人的身影，且经严格审问还的确是郑芝龙的人。